Зібрання Запорізького краєзнавчого музею налічує понад 100 тисяч одиниць зберігання.Основна експозиція представляє історію краю з найдавніших часів до сьогодення, показує його природу, життя і побут запорозьких козаків.Велику історичну цінність мають археологічні, етнографічні, нумізматичні колекції, гербарії, стародруки. Серед колекцій: палеонтологічні залишки тварин неогенового та антропогенового періодів; археологічні знахідки із Запорізького кургану; сарматські прикраси; колекції комах; опудала рідкісних птахів; зброя й предмети побуту запорозьких козаків.Окрема виставкова зала «Нестор Махно та його час» присвячена подіям Української революції 1917–1921 років у степах Запоріжжя.